SOFTWARES EM METATRANSCRIPTOMA: O EXPONENCIAL IMPACTO DO BIG DATA NA SAÚDE HUMANA.

Objetivo: Reconhecendo a importância dos estudos de microbioma para a saúde humana e além, nos esforçamos para fornecer uma revisão abrangente das tecnologias, algoritmos e softwares na análise metatranscriptômica existentes, especificamente os métodos de análise de dados. Resultados: Foram discutidas e comparadas as seguintes análises: a tecnologia de sequenciamento de alto rendimento; softwares de pré-processamento dos reads e análise de alta qualidade de dados; ferramentas e funções dos montadores de novo; atribuições das ferramentas de classificação de taxonomia; ferramentas de anotação funcional; desafios na análise de expressão diferencial de genes; e por último detalhes de fluxos de trabalho, recursos e as ferramentas específicas de bioinformática. Considerações finais: Atualmente, os estudos exigem um grande número de ferramentas para ajudar em todos os aspectos da análise de dados. Avanços em tecnologias de sequenciamento continuarão impulsionando o desenvolvimento da análise do metatranscriptoma. Um workflow padrão deve ser aceito para comparar novas ferramentas, o que ajudaria o progresso de trabalho mais precisos e apropriados. Apesar de alguns dos problemas com a metatranscriptômica como método, fica claro que a próxima geração de ferramentas será uma grande promessa para impulsionar e facilitar nossa compreensão da fração biologicamente ativa de microbioma das vias relevantes envolvidas.