AVALIAÇÃO IN SILICO DO IMPACTO FUNCIONAL DE SNPS ASSOCIADOS À ASMA

A asma é uma doença inflamatória crônica das vias aéreas, caracterizada por hipersecreção de muco, hiperresponsividade brônquica e obstrução intermitente ao fluxo aéreo. A etiologia e a progressão da asma dependem de fatores ambientais, epigenéticos e genéticos. Vários genes e variantes genéticas foram investigados, destacando-se o gene do receptor do beta-2-adrenérgico (ADRB2) e seus polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) rs1042713 e rs1042714. Contudo, pouco se sabe sobre a repercussão funcional destes SNPs. Neste sentido, a bioinformática associa conhecimentos de diferentes áreas para elucidar eventos biológicos e possibilita a predição de funções dos genes, relação entre genes e proteínas e identificação de proteínas diferencialmente expressas como potenciais alvos terapêuticos. Este trabalho objetiva analisar os impactos funcionais das variantes rs1042713 e rs1042714 do gene ADRB2. Para este fim, foram explorados os bancos RVarBase© , GTExPortal, Haploreg e Ensembl©. O RVarBase apresenta a relação destas variantes com o estado da cromatina e com a expressão de outros genes (MEPCE, CKMT2-AS1, ZCCHC9, ZCWPW1 e OXA1L, este último associado apenas ao rs1042713). Aparentemente, apenas para o rs1042713 está associado à abundância de RNAm do receptor ADRB2. No GTEx, o ABRB2 relaciona-se com a fisiopatologia da asma por meio de sua expressão no tecido pulmonar e os SNPs rs1042713 e rs1072714 resultam de uma mutação missense, portanto, seus efeitos são potencialmente estruturais. O HaploReg não dispõe de dados sobre o gene ADRB2, uma vez que esse é um gene constituído por éxon único e a plataforma investiga regiões não codificantes em blocos de haplótipos, mas apresenta 34 SNPs de outros genes relacionados à asma, à resposta a broncodilatadores e início da asma na infância. A análise do Ensembl revela as frequências alélicas dos SNPs para populações africanas, americanas, leste-asiáticas, europeias e sul-asiáticas. Entretanto, não há dados para a população brasileira, destacando a necessidade de estudos genéticos e computacionais nesta população. O rs1042713 está associado a um fenótipo não especificado, asma noturna e resposta a fármacos. Suas consequências funcionais incluem duas variações missense e consequências regulatórias. Já o rs1042714, está associado a um fenótipo não especificado e polimorfismos em ADRB2. Ademais, possui como consequência o stop gained, variação missense ou consequências regulatórias. Assim, a análise in silico possibilitou o estudo da relação das variantes e da fisiopatologia da asma em diversas populações, a expressão do gene em tecidos específicos, consequências regulatórias e associação com o estado da cromatina. No entanto, ainda são necessários estudos na população brasileira.